Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms