Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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