Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra5Q8BHJ7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms