Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX0

Trim23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim23Q8BGX0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim23Q8BGX0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim23Q8BGX0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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