Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms