Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas4Q8BGD7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms