Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pcsk9Q80W65 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk9Q80W65 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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