Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms