Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms