Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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