Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms