Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms