Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms