Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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