Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms