Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms