Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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