Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms