Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCW6

Cnfn, Cornifelin, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnfnQ6PCW6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnfnQ6PCW6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms