Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl2Q6PA06 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl2Q6PA06 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl2Q6PA06 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms