Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms