Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gga2Q6P5E6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gga2Q6P5E6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gga2Q6P5E6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gga2Q6P5E6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gga2Q6P5E6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms