Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms