Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZB0

Dnajc8, DnaJ homolog subfamily C member 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc8Q6NZB0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc8Q6NZB0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc8Q6NZB0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc8Q6NZB0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc8Q6NZB0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc8Q6NZB0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc8Q6NZB0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc8Q6NZB0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc8Q6NZB0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc8Q6NZB0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc8Q6NZB0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc8Q6NZB0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc8Q6NZB0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc8Q6NZB0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms