Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms