Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Tpm4Q6IRU2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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