Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms