Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg9bQ6EBV9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg9bQ6EBV9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg9bQ6EBV9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg9bQ6EBV9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg9bQ6EBV9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Atg9bQ6EBV9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atg9bQ6EBV9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atg9bQ6EBV9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atg9bQ6EBV9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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