Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms