Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cep170Q6A065 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cep170Q6A065 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cep170Q6A065 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Cep170Q6A065 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms