Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmcc1Q69ZZ6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms