Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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