Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms