Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9aQ68FE2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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