Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms