Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim24Q64127 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms