Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phc1Q64028 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc1Q64028 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms