Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms