Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Vat1Q62465 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Vat1Q62465 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms