Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ss18Q62280 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ss18Q62280 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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