Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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PtprrQ62132 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprrQ62132 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprrQ62132 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprrQ62132 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PtprrQ62132 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PtprrQ62132 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PtprrQ62132 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PtprrQ62132 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PtprrQ62132 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprrQ62132 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PtprrQ62132 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms