Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms