Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms