Protein–RNA interactions for Protein: Q61481

Pde1a, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1aQ61481 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pde1aQ61481 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1aQ61481 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pde1aQ61481 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1aQ61481 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pde1aQ61481 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1aQ61481 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1aQ61481 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1aQ61481 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pde1aQ61481 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pde1aQ61481 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pde1aQ61481 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pde1aQ61481 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pde1aQ61481 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde1aQ61481 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Pde1aQ61481 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde1aQ61481 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde1aQ61481 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde1aQ61481 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1aQ61481 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1aQ61481 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1aQ61481 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1aQ61481 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pde1aQ61481 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pde1aQ61481 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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