Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PcolceQ61398 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PcolceQ61398 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PcolceQ61398 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PcolceQ61398 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PcolceQ61398 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PcolceQ61398 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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