Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2bQ61313 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms