Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln3Q61124 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms