Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sim1Q61045 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms