Protein–RNA interactions for Protein: Q61037

Tsc2, Tuberin, mousemouse

Predictions only

Length 1,814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc2Q61037 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc2Q61037 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc2Q61037 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms