Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
JrkQ60976 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms